原址为60年代的上海钟表配件老厂房，艺术家杨惠姗在规划时特意保留一部份建筑结构，加入琉璃及牡丹等元素，赋予建筑新生命，并因此入选英国伦敦庞贝蓝钻（Bombay Sapphire）设计大赏。

在杨惠姗的设计里，琉璃成为这座博物馆的精神，而牡丹则是中国人期待的美好象征，也是杨惠姗在创办琉璃工房的视觉标志，代表着琉璃艺术的光辉，在这个新的时代，因为这座博物馆而照耀世界。

博物馆通高14.7米，面积2400m2，集结艺术、文化、收藏研究、美的课堂以及书籍，永不落幕的交流平台。

博物馆外墙盛开的铁网牡丹花，5025片花瓣组合而成，纯手工制作，重达1.5吨，宽度超过54公尺，入夜，花姿绚丽，被誉为“上海最美博物馆”。